首先，需准备一系列齐全且规范的申请材料。一般包括但不限于《公司登记（备案）申请书》，该申请书应如实填写公司的基本信息、变更事项等内容；《指定代表或者共同委托代理人授权委托书》，明确委托办理工商变更登记的代理人信息及授权范围；股东会决议或股东决定（依据公司类型及变更情形而定），该决议或决定应符合《公司法》及公司章程规定的表决程序与内容要求；股权转让协议原件，作为股权变更的核心依据；出让方与受让方的身份证件复印件，以核实当事人身份信息；修改后的公司章程或者公司章程修正案，确保章程内容与股权变更后的实际情况相一致；公司营业执照副本原件，用于登记机关核对公司基本信息并在变更登记后换发新证。

准备好上述材料后，将其提交至公司登记机关（通常为当地市场监督管理局）。登记机关会对申请材料进行形式审查，主要检查材料是否齐全、是否符合法定形式、签字盖章是否完备等。若材料存在问题或瑕疵，登记机关会一次性告知申请人需要补正的全部内容，申请人应在规定时间内完成补正并重新提交。

公司章程与股东协议堪称企业运营的基本准则与股东间的契约基石，对股权变更的规则与限制有着明确而细致的规定。其中涵盖了诸如股权变更的审批流程、优先购买权的行使条件、特殊情形下的限制条款等重要内容。例如，某些公司章程规定，股东向外部第三方转让股权时，必须先获得内部其他股东过半数的同意票；又如，在特定时期或特定条件下，可能限制部分股东的股权转让行为。因此，在进行股权变更操作前，对这些文件进行全面、深入且细致的审查，是确保变更行为合法合规、顺利推进的关键前置步骤。